I giochi anime presentano spesso grafiche distintive, tra cui design dei personaggi espressivi, ambientazioni colorate e presentazioni cinematografiche. Molti titoli incorporano anche strutture guidate dalla trama, utilizzando scene di dialogo, filmati o progressioni episodiche per sviluppare i personaggi e la costruzione del mondo nel tempo.
I formati di gioco dei giochi anime possono variare ampiamente. Alcuni si concentrano sul combattimento d'azione con controlli in tempo reale, mentre altri utilizzano sistemi a turni in cui il tempismo e la pianificazione sono più importanti dei riflessi.
I sistemi di progressione e raccolta sono comuni in questo tipo di gioco. I giocatori possono sbloccare nuovi personaggi, migliorare le abilità e costruire squadre che si adattano a diverse strategie o stili di gioco.
Molti giochi anime includono elementi online come eventi, aggiornamenti e modalità competitive o cooperative, pur mantenendo una forte attenzione su narrazione e sviluppo dei personaggi.